Strona Internetowa Zakładu
Kierownik
Pracownicy
- prof. dr hab. Jolanta Zakrzewska-Czerwińska
- dr hab. Marcin Szafran
- dr inż. Marcin Wolański
- dr Bernhard Kepplinger
- dr Martyna Gongerowska-Jac
- dr Agnieszka Strzałka
- dr inż. Joanna Hołówka
- dr Monika Pióro
- dr Tomasz Łebkowski
Doktoranci
(pokoje 2.24, 2.25, 3.18)
- mgr Katarzyna Pawlikiewicz
- mgr inż. Marta Derkacz
- mgr Patrycja Wadach
- mgr Jakub Mikołajczyk
- mgr Anna Musiolik
- mgr Kamil Sobarnia
- mgr Kinga Klich
- mgr Elżbieta Kryska
- mgr Dominik Bania
Tematyka badań
Architektura chromosomu bakteryjnego i kluczowe etapy cyklu komórkowego (replikacja, segregacja chromosomów oraz podział komórkowy) Gram-dodatnich bakterii należących do promieniowców: Streptomyces i Mycobacterium.
Wyposażenie naukowe
- Real Time PCR – StepOnePlus (Applied Biosystem)
- Eco Real-Time PCR System (Illumina)
- Spektrofotometry UV/Vis – Nano-drop ND-1000, Pharmacia Biotech
- Wirówki: AVANTI® J-26 XPI (Beckman), Allegra X-22R (Beckman), 5415R (Eppendorf), Micro FC5515R (Ohaus)
- Inkubatory do hodowli bakteryjnych – Excella E-24R (New Brunswick Scientific), Infors HT Multitron, Binder CO2 incubator (Binder)
- Czytnik spektrofotometryczny do analizy wzrostu drobnoustrojów w czasie rzeczywistym – Bioscreen C
- Mikroskopy fluorescencyjne odwrócone – Delta-Vision Elite z systemem mikroprzepływowym CellASIC, ONIX
- Mikroskop fluorescencyjny prosty – Leica DM6 B
- Komora do nastawiania reakcji Real Time PCR – Aura PCR (Bioair / Euroclone)
- Komory laminarne – BIO60 (Faster), Mars Safety Class 2 (ScanLaf)
- Zamrażarki niskotemperaturowe – C340 (New Brunswick Scientific), Igloo C820 (Telstar), MDF-DU502VH-PE (PHCbi)
- Suszarka i cieplarka mikrobiologiczna (Binder)
- Autoklawy –Varioklav 75S, Tutnauer 2840EL-D
- System do elektroforezy kapilarnej – QIAxcel (Qiagen)
- Czytnik płytek – Infinite M Plex (Tecan)
- System do chromatografii – Akta Start (GE / Cytiva)
- Systemy do wizualizacji żeli – ChemiDoc XRS+ (Bio-Rad), Smart Imaging (Vilber)
- System do oczyszczania wody Simplicity UV (Millipore)
Projekty badawcze
Trwające:
2024-2028: „W poszukiwaniu mechanizmów molekularnych kontrolujących zależne od białka ParB zmiany architektury chromosomu Streptomyces.” (NCN, OPUS 25; nr 2023/49/NZ1/00781).
Kierownik projektu – M. Szafran
2024-2028: „Współdziałanie białek wiążących nukleoid i czynników transkrypcyjnych w regulacji ekspresji genów u bakterii produkujących antybiotyki.” (NCN, OPUS 25, nr 2023/49/B/NZ2/00356)
Kierownik projektu – D. Jakimowicz
2023-2027: „Identyfikacja nowych antybiotyków poprzez indukcję nieaktywnych klastrów genów.” (NCN, OPUS 24; 2022/47/B/NZ1/00556)
Kierownik projektu – B. Kepplinger
2022-2025: „Nowy system dwuskładnikowy u Streptomyces i jego rola w regulacji wzrostu oraz zwalczaniu konkurencji międzygatunkowej.” (NCN, SONATA 17; nr 2021/43/D/NZ2/00284)
Kierownik projektu – M. Gongerowska-Jac
2021-2025: “Architektura chromosomu i jego translokacja w asymetrycznie rosnących i dzielących się komórkach Mycobacterium” (NCN, OPUS 19; nr 2020/37/B/NZ1/0055)
Kierownik projektu – J. Zakrzewska-Czerwińska
2021-2024: “Jak komórki produkujących antybiotyki bakterii rosną i rozgałęziają się?” (NCN, SONATA 16; nr 2020/39/D/NZ1/00303)
Kierownik projektu – B. Kepplinger
Zakończone (ostatnie pięć lat):
2019-2022: „Organizacja przestrzenna chromosomu podczas sporulacji Streptomyces – wpływ na podziały komórkowe, segregację chromosomów, przeżywalność i kiełkowanie zarodników.” (NCN, OPUS 16, nr 2018/31/B/NZ1/00614).
Kierownik projektu – D. Jakimowicz
2019-2022 „Pupylacja i acetylacja, dwie potranslacyjne modyfikacje lizyny i ich rola w regulacji topologii chromosomu Streptomyces”. (NCN, SONATA 14, nr 2018/31/D/NZ1/00287).
Kierownik projektu – M. Szafran
2019-2022: „Dynamika cyklu życiowego „żywego antybiotyku”, Bdellovibrio bacteriovorus, w trakcie drapieżnictwa na bakteriach chorobotwórczych”. (NCN, OPUS 15; nr. 2018/29/B/NZ6/00539).
Kierownik projektu – J. Zakrzewska-Czerwińska
2018-2022: „Mechanizm segregacji chromosomów u Mycobacterium – rola białek oddziałujących z ParA.” (NCN, OPUS 14; nr. 2017/27/B/NZ1/00823).
Kierownik projektu – D. Jakimowicz
2018-2021: “mIHF, a unique mycobacterial nucleoid associated protein and its role in chromosome organization and gene expression.” (NCN, SONATINA 2; nr. 2018/28/C/NZ1/00128).
Kierownik projektu – J. Hołówka
2018-2021: „Rola współpracy pomiędzy białkami HupA i HupS podczas wzrostu i odpowiedzi na stres środowiskowy bakterii Streptomyces.” (NCN, SONATINA 2; nr. 2018/28/C/NZ1/00241).
Kierownik projektu – A. Strzałka
2019-2020: „Globalna analiza transkrypcji genów zależnych od białka AdpA u bakterii Streptomyces w warunkach zmiennej dostępności tlenu.” (NCN, Miniatura 3).
Kierownik projektu – M. Wolański
2018-2019: „Biologiczna funkcja fosforylacji inicjatorowego białka DnaA ze Streptomyces coelicolor.” (NCN, Preludium 13).
Kierownik projektu – T. Łebkowski
2017-2020: „Białko Lsr2 jako globalny organizator chromosomu i czynnik transkrypcyjny u Mycobacterium – współdziałanie pomiędzy Lsr2 oraz białkami SMC i HupB.” (NCN, Opus 13).
Kierownik projektu – J. Zakrzewska-Czerwińska
2017-2020: „Architektura segrosomu bakteryjnego – współdziałanie topoizomerazy I i białka segregacyjnego ParB u Streptomyces”. (NCN, Harmonia 8).
Kierownik projektu – M. Szafran
2017-2019: „Narzędzie genetyczne do identyfikacji regulatorów topologicznie wrażliwego promotora genu kodującego topoizomerazę I u Streptomyces coelicolor.” (NCN, Preludium 12).
Kierownik projektu – M. Gongerowska-Jac