Kierownik
Pracownicy
- prof. dr hab. Dagmara Jakimowicz
- dr inż. Marcin Wolański
- dr Marcin Szafran
- dr Agnieszka Strzałka
- dr inż. Joanna Hołówka
- dr Monika Pióro
- dr Martyna Gongerowska-Jac
- dr Łukasz Makowski
- dr Tomasz Łebkowski
- dr Bernhard Kepplinger
Doktoranci
(tel. 71-375-2393, -2640, pokoje 3.17, 3.18)
- mgr Marta Kołodziej
- mgr Izabela Magierowska
- mgr Justyna Szymczak
- mgr inż. Hanna Kąkolewska
- mgr Katarzyna Pawlikiewicz
- mgr Julia Duława
- mgr Karolina Mojsa
Tematyka badań
Architektura chromosomu bakteryjnego i kluczowe etapy cyklu komórkowego (replikacja, segregacja chromosomów oraz podział komórkowy) Gram-dodatnich bakterii należących promieniowców: Streptomyces i Mycobacterium oraz Gram-ujemnej, drapieżnej bakterii Bdellovibrio bacteriovorus.
Wyposażenie naukowe
- Real Time PCR – StepOnePlus (Applied Biosystem)
- Eco Real-Time PCR System (Illumina)
- Spektrofotometry UV/Vis – Nano-drop ND-1000, Pharmacia Biotech
- Wirówki: AVANTI® J-26 XPI (Beckman), Allegra X-22R (Beckman), 5415R (Eppendorf), Micro FC5515R (Ohaus)
- Inkubatory do hodowli bakteryjnych – Excella E-24R (New Brunswick Scientific), Infors HT Multitron, Binder CO2 incubator (Binder)
- Czytnik spektrofotometryczny do analizy wzrostu drobnoustrojów w czasie rzeczywistym – Bioscreen C
- Mikroskopy fluorescencyjne odwrócone – Delta-Vision Elite z systemem mikroprzepływowym CellASIC, ONIX
- Mikroskop fluorescencyjny prosty – Leica DM6 B
- Komora do nastawiania reakcji Real Time PCR – Aura PCR (Bioair / Euroclone)
- Komory laminarne – BIO60 (Faster), Mars Safety Class 2 (ScanLaf)
- Zamrażarki niskotemperaturowe – C340 (New Brunswick Scientific), Igloo C820 (Telstar), MDF-DU502VH-PE (PHCbi)
- Suszarka i cieplarka mikrobiologiczna (Binder)
- Autoklawy –Varioklav 75S, Tutnauer 2840EL-D
- System do elektroforezy kapilarnej – QIAxcel (Qiagen)
- Czytnik płytek – Infinite M Plex (Tecan)
- System do chromatografii – Akta Start (GE / Cytiva)
- Systemy do wizualizacji żeli – ChemiDoc XRS+ (Bio-Rad), Smart Imaging (Vilber)
- System do oczyszczania wody Simplicity UV (Millipore)
Projekty badawcze
Trwające:
2021-2025: „Architektura chromosomu i jego translokacja w asymetrycznie rosnących i dzielących się komórkach Mycobacterium”. (NCN, OPUS 19; nr. 2020/37/B/NZ1/0055).
Kierownik projektu – J. Zakrzewska-Czerwińska
2019-2022: „Organizacja przestrzenna chromosomu podczas sporulacji Streptomyces – wpływ na podziały komórkowe, segregację chromosomów, przeżywalność i kiełkowanie zarodników”. (NCN, OPUS 16, nr 2018/31/B/NZ1/00614).
Kierownik projektu – D. Jakimowicz
2019-2022 „Pupylacja i acetylacja, dwie potranslacyjne modyfikacje lizyny i ich rola w regulacji topologii chromosomu Streptomyces”. (NCN, SONATA 14, nr 2018/31/D/NZ1/00287).
Kierownik projektu – M. Szafran
Kierownik projektu – J. Zakrzewska-Czerwińska
2018-2022: „Mechanizm segregacji chromosomów u Mycobacterium – rola białek oddziałujących z ParA”. (NCN, OPUS 14; nr. 2017/27/B/NZ1/00823).
Kierownik projektu – D. Jakimowicz
Kierownik projektu – J. Hołówka
Kierownik projektu – A. Strzałka
Zakończone (ostatnie pięć lat):
Granty NCN:
2019-2020: „Globalna analiza transkrypcji genów zależnych od białka AdpA u bakterii Streptomyces w warunkach zmiennej dostępności tlenu”. (NCN, Miniatura 3).
Kierownik projektu – M. Wolański
2018-2019: „Biologiczna funkcja fosforylacji inicjatorowego białka DnaA ze Streptomyces coelicolor”. (NCN, Preludium 13).
Kierownik projektu – T. Łebkowski
2017-2020: „Białko Lsr2 jako globalny organizator chromosomu i czynnik transkrypcyjny u Mycobacterium – współdziałanie pomiędzy Lsr2 oraz białkami SMC i HupB”. (NCN, Opus 13).
Kierownik projektu – J. Zakrzewska-Czerwińska
2017-2020: „Architektura segrosomu bakteryjnego – współdziałanie topoizomerazy I i białka segregacyjnego ParB u Streptomyces”. (NCN, Harmonia 8).
Kierownik projektu – M. Szafran
2017-2019: „Narzędzie genetyczne do identyfikacji regulatorów topologicznie wrażliwego promotora genu kodującego topoizomerazę I u Streptomyces coelicolor”. (NCN, Preludium 12).
Kierownik projektu – M. Gongerowska-Jac
2017-2018: „Dynamika replikacji chromosomu na poziomie pojedynczej komórki u drapieżnej bakterii Bdellovibrio bacteriovorus„. (NCN, Preludium 12).
Kierownik projektu – Ł. Makowski
2015-2018: „Topologia chromosomu jako regulator transkrypcji – współdziałanie topoizomeraz i białek wiążących DNA w odpowiedzi bakterii na stres środowiskowy”. (NCN, Opus 8).
Kierownik projektu – D. Jakimowicz
2015-2018: „Dopasowanie mechanizmu segregacji chromosomów do cyklu komórkowego u bakterii -analiza oddziaływań białka ParA in vitro i in vivo”. (NCN, Harmonia 6).
Kierownik projektu – D. Jakimowicz
2012-2018: „Dynamika organizacji chromosomu oraz procesu replikacji w różnych fazach wzrostu bakterii – porównanie dwóch spokrewnionych promieniowców: chorobotwórczego Mycobacterium i niechorobotwórczego, rosnącego w postaci strzępek Streptomyces”. (NCN, Maestro 2).
Kierownik projektu – J. Zakrzewska-Czerwińska
Granty NCBiR:
2015-2018: „Immunosupresanty Następnej Generacji – Brazilikardyna syntezowana przez bakterie Nocardia spp.”. (ERA-IB).
Kierownik projektu – J. Zakrzewska-Czerwińska