15.03.2022., godzina 10:00, sala 1.03.

Zapraszamy wszystkich pracowników i studentów na seminarium wydziałowe, podczas którego swoje wystąpienie zaprezentuje mgr Krystian Bacławski z Zakładu Inżynierii Oprogramowania, Instytutu Informatyki, Wydziału Matematyki i Informatyki, UWr.

Wykład: „Przyspieszanie analizy genomów przy pomocy wyspecjalizowanych jednostek obliczeniowych” będzie w języku polskim.

Algorytmy dopasowania sekwencji są powszechnie stosowane w bioinformatyce. Mimo wyraźnych postępów problem składania ludzkiego genomu (z milionów krótkich sekwencji) nadal zajmuje dziesiątki godzin pracy nowoczesnych komputerów. Czy można przyspieszyć te obliczenia przy pomocy wyspecjalizowanych jednostek obliczeniowych? Postaram się odpowiedzieć na to pytanie korzystając z materiałów do seminarium “Accelerating Genome Analysis with FPGAs, GPUs, and New Execution Paradigms” prowadzonym na ETH Zurich.

Accelerating Genome Analysis: A Primer on an Ongoing Journey, Alser, 2020.